中心隶属于控制工程学院，实行校、院两级管理机制，其组织管理体系框架健全，职责和任务明确。在人事管理和行政上归属控制工程学院，是中心教师能够参与到理论教学和科研工作，也能够使更多理论课任课教师参与到实验室建设和实验教学改革中来，而实验中心的运行经费及专项建设项目由学校直接投入，有利于学校实验室建设资金的合理使用，保证中心的建设和发展。中心坚持科学规划、资源整合、开放共享、高效管理的原则，建设面向仪器科学与技术、电子信息、控制科学与工程、机械工程等多个学科，面向测控技术与仪器、自动化、机械工程、电气工程及自动化、电子信息工程等多个专业的实验教学中心。中心实行主任负责制，同时，构建了由中心主任领导，按层次化教学体系，专兼职结合、理论和实验相结合、科研与实践相结合的实验教学团队，以高水平教授带动团队教师进行实验室建设、教学研讨、科研成果向实验教学转化、实验教学改革和自制仪器设备等。实验室主任则负责实验室所承担的实验课程的教学改革的具体实施过程。